Zum 1. Januar 2024 wird Matthias Pasdzierny die Akademie-Juniorprofessur mit Tenure-Track (W2) an der Universität der Künste (UdK) Berlin antreten. BBAW und UdK tragen die Juniorprofessur gemeinsam.
Matthias Pasdzierny leitet die Berliner Arbeitsstelle der Bernd Alois Zimmermann-Gesamtausgabe. Das von der Berlin-Brandenburgischen Akademie der Wissenschaften und der Akademie der Wissenschaften und der Literatur, Mainz, gemeinsam getragene Akademienvorhaben ist das erste musikwissenschaftliche Editionsvorhaben für die Musik nach 1945. Das Projekt gehört zu dem von Bund und Ländern geförderten Akademienprogramm.